Осенью 1993 года, в течение нескольких недель от визита в Литву, Папа Римский Иоанн Павел II посетил францисканский монастырь на горе Ла Верна в Италии и призвал братьев  францисканцев у Горы Крестов построить монастырь. Францисканцы вскоре откликнулись на призыв Папы. Проект монастыря подготовили архитекторы Анджело Полеселло и Нунзио Риммаудо; курировал строительство главный архитектор Шяуляйского района А. Юкна. Краеугольный камень привезли с горы Ла Верна, его освятил Папа Иоанн Павел II. Внутри камня поместили капсулу с документами об учреждении монастыря. Строительству здания, расположенного в примерно 300 метров от Горы Крестов, способствовали братья францисканцы из Тосканской провинции.

Построенный монастырь торжественно освящен 8 июля 2000 года.

В монастыре оборудованы нескольео келий, часовня, библиотека. Часовня украшена витражами Альгирдаса Довиденаса, на тему истории францисканского монашества, выразительным алтарем и скинией (автор - художник Римантас Сакалускас). На рельефах алтаря отражена взаимосвязь между Горой Крестов и горой Ла Верна. Во время молитвы на этой горе св. Франциск получил стигматы - раны Христа.

В этой обители Малых Братьев (лат. Ordo Fratrum Minorum) находится новициат литовской францисканской провинции святого Казимира. Братья францисканцы также являются и опекунами Горы Крестов. В монастырь приглашаются желающие собраться с мыслями и помолиться в тишине паломники.